ÚHÚL působí jako odborná organizace Ministerstva zemědělství pro oblast lesnictví a myslivosti. Působnost ústavu je celorepubliková, ústředí sídlí v Brandýse nad Labem. Jednou z hlavních činností organizace je provádění Národní inventarizace lesů, od roku 2015 v podobě projektu Sledování stavu a vývoje lesních ekosystémů. ÚHÚL vede centrální databázi s informacemi o lesích ČR, lesním hospodářství a myslivosti.